Il Giardino prende il nome dal principe Eugenio di Savoia Carignano, che alla metà del XIX secolo risiedette nell’appartamento orientato verso il giardino.

È il più antico dell’intero complesso, e da sempre fu riservato all’uso privato degli inquilini dell’appartamento, fra cui si ricorda il botanico Ippolito Durazzo che a Genova creò il Giardino botanico dello Zerbino e quello dell’attuale Villetta Di Negro.

Il Giardino di Palazzo Reale mantiene ancora oggi mantiene quest’aurea di mistero, estenedendosi sino alle sale dell'appartamento (attualmente sede degli uffici del Mibac) che per la prima volta saranno aperte al pubblico.